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病毒研究用水系列三:如何獲得完美的核酸電泳條帶

瀏覽次數:2073發布日期:2020-07-03

在病毒的分子生物學研究中,電泳技術是一個重要方法,主要用于核酸、蛋白質的分離與鑒定,使用的實驗儀器主要是電泳儀。本文,樂楓純水為大家總結了實驗中常出現的問題和解決方法。

<span class='bjFfcClass' style='color:red' >新冠</span>病毒研究儀器用水

一、什么是核酸電泳?

    核酸電泳是基因操作的核心技術之一,用于分離、鑒定DNA、RNA 分子混合物和純化DNA的片段。

二、核酸電泳異常條帶問題 

    核酸電泳實驗中,常常會遇到條帶模糊、拖尾、扭曲等現象,究其原因,除了操作不當,電泳條件未優化,電泳緩沖液也是重要的影響因素之一。電泳緩沖液的組成及其離子強度影響DNA的電泳遷移率。

異常電泳條帶

 

表1 核酸電泳條帶異常的原因匯總及建議的解決方法

 

常見問題

原因

解決方法

條帶模糊

核酸降解

使用不含核酸酶的超純水配置緩沖液

電泳緩沖液陳舊

建議經常更換緩沖液

有蛋白污染

使用低有機物的超純水配置緩沖液

核酸變性

使用超純水或者緩沖液稀釋樣品

條帶黯淡

核酸濃度過低

增加上樣量

核酸降解 

使用不含核酸酶的超純水配置緩沖液

條帶被示蹤染料掩蓋

避免使用與目的片段遷移率相同的示蹤染料

拖帶或涂抹帶

PCR體系或PCR程序不合適

優化PCR體系和PCR程序

條帶扭曲

配膠緩沖液和電泳緩沖液不同

配膠和電泳中使用同一批緩沖液

電泳時電壓過高

控制電泳時電壓不超過6V/CM

三、核酸電泳用純水要求

    為了防止水中雜質(如:核酸酶、蛋白質、離子等)對電泳結果的影響,核酸電泳實驗配置緩沖溶液或稀釋樣品需要使用超純水:

● 電阻率 18.2 MΩ·cm

●TOC < 10 ppb

● 無核酸酶

● 細菌總數< 1 CFU/mL

● 熱原< 0.005 EU/mL

● 0.22 μm 或更低的顆粒過濾

四、核酸電泳用純水機推薦

    樂楓生物新一代Genie系列智能純水系統是一款專注于解決用戶需求的實驗室純水機。Genie系列智能純水系統采用樂楓的理念——無線連接、“1+N”模式,具有系統智能化、設計人性化、水質標準化三大特色。

廣州某疾控中心安裝的Genie G

廣州某疾控中心安裝的Genie G以自來水為進水產EDI純水和超純水

荷蘭安裝的Genie U

荷蘭安裝的Genie U以自來水為進水產RO純水和超純水

穩定可靠的水質

• 集合優化的流路設計的 EDI 模塊和樂楓LeFil 和OrganeFil 配方填料的超純化柱,純水和超純水水質達到或超過相關實驗室用水標準;

• 配備RephiBio 終端過濾器,可有效去除水中的熱原(內毒素)、核酸酶、細菌等雜質,滿足核酸電泳實驗用水要求。

用戶體驗

• 觸控屏采用高靈敏度防水屏幕,可帶乳膠手套操作

• 采用智能IT技術,取水手柄與主機可無線連接,取水點與主機的距離不受電線長度的限制,讓您享受“無線 · 自由”的用水體驗;

• 遠程取水終端的手柄設計符合人體工學,升降只手操作;亦可實時查看水質信息,完成手動取水或定量取水等操作

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